제3교실은 ‘수학전문 아카데미’를 표방하고 있으며, 주 3회 1일 50분 선생님의 집을 방문해 공부하는 시스템으로이다. 10~15분에 불과한 주간 방문 학습지와 달리, 선생님인 홈티처의 가정에서 충분한 시간 동안 체계적 학습이 가능하다. 또한, 교과서 편찬 위원들이 집필한 교재를 사용해 학습의 질을 높였다. 따로 학습해야 했던 기초계산력 향상을 위한 연산편과 학년별 교과과정에 맞춘 교과편을 함께 공부할 수 있는 투웨이 시스템을 갖추었고, 온라인 상에서도 자동 문제 생성(COS) 시스템으로 1:1 맞춤학습이 이루어진다.