시립청소년성문화센터는 청소년 성교육·성문화·성상담 사업을 기반으로 전문적인 프로그램을 개발·운영하는 공공기관이다. 어린이·청소년의 인권이 보장되고 평등하고 건강한 성문화가 정착될 수 있도록 다양한 교육 및 연구, 정책 지원 사업을 추진하고 있다. 본 센터는 ‘서울특별시 청소년시설 설치 및 운영에 관한 조례’와 ‘아동·청소년의 성보호에 관한 법률’에 근거해 운영되고 있다. 주요 사업으로는 △청소년 성교육 및 상담 프로그램 개발·운영 △청소년 성교육 체험관 및 찾아가는 성교육 운영 △청소년 성교육·상담 전문지도자 양성 △관련 기관 연계 및 지원 △청소년 성문화 관련 조사 및 정책 연구 등이 있다.