아리마 지노믹스, 조기 액세스 프로그램 종료하고 아리마-HiC 플랫폼 개시
크로마틴 형태 및 지놈 어셈블리 연구를 통해 높은 통찰력을 제공해줄 한층 개선된 아리마-HiC 제품 출시
아리마-HiC 샘플 준비 키트는 다양한 어플리케이션에 걸쳐 사용될 수 있는 장거리 크로마틴(염색질) 상호작용 탐지를 가능하게 하는 6시간의 신속 간단한 프로토콜이다. 이번의 출시는 제품 성능을 입증하고 일부 연구자들로부터 귀중한 의견을 입수할 수 있었던 조기 액세스 프로그램을 완결하게 된다.
조기 액세스 프로그램이 소규모로 진행된 까닭에 회사는 고객들과 긴밀하게 협업을 할 수 있었고 이로써 보다 품질이 개선된 아리마-HiC 제품을 개발할 수 있었다. EMBL의 지놈 생물학 부문 책임자인 아일린 퍼롱(Eileen Furlong) 박사는 “새로운 아리마-HiC 키트에 대해 우리는 매우 만족한다. 아리마-HiC 프로토콜은 이전 버전에 비해 며칠이나 더 빠른 속도를 갖고 있다. 전체적으로 평가할 때 이는 더 적은 노력으로 더 나은 품질의 데이터를 획득할 수 있게 한다”고 말했다. 낮은 샘플 인풋을 요하는 연구에 대한 고객들의 요구에 부응하여 아리마-HiC 키트는 어플리케이션에 따라 10만 개 미만의 세포로부터 고품질의 Hi-C 라이브러리를 구성할 수 있게 한다. MIT의 박사후 과정 펠로우인 하이루이 메하레나(Hiruy Meharena) 박사는 “우리는 아리마-HiC 워크플로우의 사용 용이성과 위상 도메인 및 크로마틴 루핑 분석에서 데이터 품질 향상에 대해 매우 만족스럽게 느낀다. 낮은 샘플 인풋 특성은 연구자들이 희귀 세포나 임상 샘플 등에 대해 Hi-C 분석을 실행하는데 매우 중요하게 작용한다. 이들 샘플에 대해서는 지금까지 거의 Hi-C 분석이 이뤄지지 못했었다”고 말했다.
데이터 분석을 보다 신속하게 하기 위해 회사는 학계 파트너들과 협업을 진행했으며 이 과정에서 아리마-HiC 데이터를 위한 HiCUP 및 SALSA 같은 오픈소스 툴에 의존했다. 이들 툴은 커버리지 균일성이 높고 장거리 신호대잡음비도 높아서 아리마-HiC 데이터의 독특한 특성을 최대한 활용하고 그럼으로써 보다 향상된 크로마틴 형태와 지놈 어셈블리 분석을 가능케 해준다. 이런 식으로 오픈소스 커뮤니티와 적극적으로 협력함으로써 회사는 샘플에서 결과로까지의 워크플로우를 단축할 수 있었고 앞으로도 이를 계속 활용한다는 방침이다. 회사는 또한 Hi-C 접근법에 관한 한 학계 연구자들과의 협업을 지속할 예정이며 이와 함께 산업계 파트너인 애질런트 테크놀로지(Agilent Technologies)와도 새로운 지놈 어플리케이션 분야에서 워크플로우를 개발한다는 계획이다.
조기 액세스 고객들로부터 얻은 의견과 데이터 또한 아리마-HiC 기술의 실효성을 입증하는데 중요한 기여를 했다. 최근에 아리마-HiC 기술을 활용한 척추동물 지놈 프로젝트(VGP) 1단계의 첫 데이터가 발표되었다. G10K 평의회(G10K Council)의 회원이자 독일 드레스덴 소재 분자세포생물학 및 유전학 막스플랑크연구소의 소장을 역임하는 진 마이어스(Gene Myers) 박사는 “아리마 지노믹스는 G10K 컨소시엄과 VGP 프로젝트 1단계에서 중요한 기술 파트너이다. 프로젝트 1단계에서 아리마가 선정된 이유는 인풋 샘플의 질과 양에서 변화가 있음에도 지속적으로 고품질 데이터를 생성할 수 있는 회사의 데이터 품질에 근거한 것이다. 아리마-HiC 데이터에서의 장거리 지놈 상호작용은 염색체에 걸친 레퍼런스 어셈블리 생성을 위한 우리 회사의 전략에서 중요한 일부분이 되고 있다”고 말했다.
고품질의 지놈 어셈블리에 더해서 다른 연구소에서도 다른 방법과 대비할 때 훨씬 낮은 정도의 배열로도 높은 신뢰도를 갖는 크로마틴 루프와 위상 관련 도메인(TAD)을 감지할 수 있는 능력을 보여준 바 있다. 마크로젠의 최고기술책임자인 김창훈 박사도 “낮은 유전자 배열 비용으로도 매우 높은 통찰력을 제공하는 아리마-HiC는 앞으로 연구자들이 지놈의 3차원 구조 내에서 유전자 조절 상황을 이해하는데 Hi-C 기술을 활용하는데 큰 도움을 줄 것이 분명하다”고 말했다.
회사가 조기 액세스 단계를 벗어나는 상황에서 아리마-HiC 기술을 연구자들이 보다 쉽게 입수할 수 있도록 사업 규모를 크게 확대했다. 회사의 영업팀을 확대하는 것에 더해서 주문배송 과정을 크게 간소화하고 고객서비스 및 고객지원 부문도 대폭 강화했다. 아리마 지노믹스의 설립자 겸 CEO인 시다르트 셀바라지(Siddarth Selvaraj)는 “아리마-HiC 키트의 상업적 출시는 유전자 배열순서 규명 및 구조에 대한 이해를 높이는 것을 사명으로 삼고 있는 우리 회사에 있어 매우 중요한 이정표가 될 것으로 믿는다. 다음 단계에서 우리의 목표는 연구자들이 Hi-C 기술을 가급적이면 쉽고도 낮은 비용으로 입수하고 사용도 쉽게 할 수 있도록 하고 그럼으로써 보다 많은 통찰력을 얻게 한다는데 있다”고 말했다.
아리마 지노믹스(Arima Genomics) 개요
아리마 지노믹스는 유전자 염기서열 및 구조에 대한 이해를 가속화하고 건강, 질병, 종의 진화에서 이들의 역할을 밝혀내는데 전념하는 바이오테크 회사이다. 회사에 대해 보다 자세한 정보는 www.arimagenomics.com 참조.
비즈니스 와이어(businesswire.com) 원문 보기:
https://www.businesswire.com/news/home/20181105005052/en/
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웹사이트: https://arimagenomics.com/
연락처
아리마 지노믹스(Arima Genomics, Inc.)
시다르트 셀바라지(Siddarth Selvaraj)
CEO
1-505-948-3116
sid@arimagenomics.com
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